Egy rendeletmódosításnak köszönhetően így a Strukturális Alapok és a Kohéziós Alap támogatásában megvalósuló projektek áfa-emelésből adódó költségnövekményét az NFÜ a projektgazdák számára kompenzálja.
Minden olyan projektgazdát kedvezőtlenül érint az általános forgalmi adó emelése, amely a projekt egészét vagy egy részét tekintve nem rendelkezik áfa-levonási joggal. Eltérő mértékben ugyan, de minden operatív programot érinthet az áfa emelése, mivel az mind az eszközbeszerzéseket, mind az igénybe vett szolgáltatásokat terheli. Ezért az NFÜ úgy kívánja felhasználni a rendelkezésre álló forrásokat, hogy a projektgazdák számára a le nem vonható áfával érintett beszerzéseket vagy szolgáltatásokat az adóemelés ne érintse kedvezőtlenül, a projektek az eredeti tartalommal és határidővel megvalósulhassanak.
Áfa-kompenzációra jogosult minden olyan projekt kedvezményezettje, ahol a pályázat költségvetése nem 27%-os áfával került megtervezésre és a projektgazda nem vagy csak részben jogosult az áfa levonására, ezért a projektje keretében elszámolható költség a le nem vonható áfa, és az áfaemelés tényleges költségnövekedést okoz.
Hogyan igényelhető a kompenzáció?
Támogatási szerződéssel, illetve támogatói okirattal rendelkező kedvezményezettek esetében:
A kompenzáció a támogatási szerződés módosítására irányuló kérelem keretében igényelhető a közreműködő szervezeten keresztül legkésőbb a záró kifizetési igényléssel egyidejűleg, és annak biztosítása a támogatási szerződés módosítását igényli. Az áfa-emelés miatti többletkiadásra is érvényesíteni kell a társfinanszírozás és kockázatmegosztás elvét (a kedvezményezettnek arányos önrészt kell biztosítania), valamint csak az igazolható és realizált többletkiadás lehet a kompenzációs kifizetés alapja.
Az áfa mértékének változása miatti költségnövekmény részletezése és a költség-növekedés mértékének alátámasztása a kedvezményezett feladata. A támogatási szerződés-módosítási kérelemhez csatolni kell a projekt megemelt áfa-mértékkel átdolgozott költségvetését.
Támogatási döntéssel, illetve támogatási szerződéssel még nem rendelkező projektek esetében:
A 2009. július 1-jét megelőzően benyújtott és 20%-os, 2009. július 1. és 2011. december 31-e között benyújtott és 25%-os ÁFÁ-val tervezett, támogatási döntéssel már rendelkező projektek esetében a költségvetés a szerződéskötést megelőzően 27%-os áfa-mértékkel és magasabb támogatási igénnyel áttervezésre kerülhet.
A 2012. január 1-je előtt már benyújtott, de támogatási döntéssel még nem rendelkező projektek esetében a támogatási döntés meghozatalakor a 25%-os áfával tervezetett projektelemek/ költségkategóriák maximálisan elszámolható költsége 1,6%-kal automatikusan megemelésre kerül.
A 20%-os áfával tervezett projektelemek esetében az elszámolható költség 5,83%-kal kerül megemelésre.
Mi a teendő?
Amennyiben a támogatási szerződéssel még nem rendelkező kedvezményezett igényt tart a megemelt támogatási összegre, úgy a támogatási szerződés megkötéséig át kell dolgoznia a költségvetését az áfa növekmény tervezett összegével, valamint nyilatkoznia szükséges az elszámolható költség megemeléséből adódó megemelkedett önrész, illetve - amennyiben releváns - biztosíték rendelkezésre állásáról.
Az áttervezés eredményeképpen a támogatási szerződésbe már a megemelkedett áfa-tartalommal kerül a megtervezett költségvetés, így ez lesz a későbbi elszámolás alapja.
Átalakítja a személyes értékesítési hálózatát a Kincstár. 
