Az ÁSZ jelentése szerint a kialakított irányítási rendszer egyik intézményben sem biztosította az átlátható, elszámoltatható és ellenőrizhető közpénzfelhasználást, valamint szabálytalan volt a pénzügyi és vagyongazdálkodás is. Szabálytalanságok voltak továbbá a kulturális javak nyilvántartásában, és a kulturális javak vagyonvédelme és állományvédelme sem volt biztosított a kölcsönzések során.
Sok volt a probléma
A pécsi Janus Pannonius Múzeum, az egri Dobó István Vármúzeum, a békéscsabai Munkácsy Mihály Múzeum, a salgótarjáni Dornyay Béla Múzeum és a kaposvári Rippl-Rónai Megyei Hatókörű Városi Múzeum ellenőrzéséről készült jelentésekből kiderül, hogy bár mind az öt múzeum jelentős szervezeti átalakuláson ment keresztül 2011-2013 között, a feladatellátás sehol sem volt megfelelő. A belső vizsgálatok és ellenőrzések rendszere sem volt megfelelően kialakítva, ezzel csorbult a múzeumok korrupcióelleni védelme.
Gyakori volt továbbá, hogy nem rendelkeztek a múzeumok a gazdálkodást meghatározó szabályzatokkal, nem készítettek adatvédelmi és adatbiztonsági szabályzatot, valamint nem szabályozták a kötelezően közzéteendő adatok nyilvánosságra hozatalának rendjét. Mindemellett egyik múzeum sem gondoskodott teljes körűen a kulturális javak nyilvántartásáról, vagyis több esetben nem rendelkeztek a kulturális javak kölcsönzése során határozott idejű, írásbeli kölcsönzési szerződéssel, illetve a szerződések nem tartalmazták a jogszabályban rögzített állományvédelemre és vagyonbiztonságra vonatkozó kötelező tartalmi elemeket.
Nem lesz zökkenőmentes az átmenet. 
