Vannak azonban belső problémák, amik növelik a kockázatot az ÁSZ szakemberei szerint, az NGM és a kincstár belső szabályzatai egyebek mellett nem biztosították a hatásköri és felelősségi viszonyok egyértelmű lehatárolását, nem tartalmazták az ellátandó feladatok részletes bemutatását sem, így az nem garantálta a feladatellátásban részt vevő szervezeti egységek számára a jogszabályok szerinti feladatellátás feltételeinek kialakítását. Mindezek ellenére azonban a feladatellátás során érvényesült a statisztikai tevékenység önállósága és a tájékoztatás függetlensége, véli a szervezet.